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Western blot 之蛋白提取

2021-08-02 来源:爱问旅游网
Western blot 之蛋白提取(protocol)

一、 蛋白提取准备:

冰浴盒、冰、小烧杯、EP管(1.5ml)、小镊子、RIPA裂解液(4℃保存,试剂盒中含PMSF,-20℃保存)、蛋白酶抑制剂(protease inhibitor tablets)、磷酸酶抑制剂(phosphatase Inhibitor cocktail 3)、15ml离心管(裂解液)、移液器、超声粉碎机、低温高速离心机、BCA蛋白定量试剂盒、96孔板、酶标仪、4×蛋白上样缓冲液(分装1ml/管,-20℃保存)、 二、 蛋白提取操作:

1. -80℃取出组织,冰上复温;由冻存管移入1.5mlEP管,并重新编号;(1、2、3、4、5、6分别为sham、3h、12h、24h、3d、7d) 2. 加裂解液;

a、裂解液配制:(10mlRIPA(4℃)+100ulPMSF(-20℃)+100ul蛋白酶抑制剂(4℃ 10×、1×)+1-2ul磷酸酶抑制剂)

注:磷酸酶抑制剂作用是保护已磷酸化蛋白,避免其降解破坏,所以加之有益无害。

b、加入EP管,1mg:10-20ul;(400ul/EP管,不要求精确)

3. 匀浆; 机械(电动匀浆机);

超声粉碎机

附:超声粉碎机操作:a、打开电源;

b、确认设置;(默认)

c、蒸馏水清洗机头;(每次换样本均要清洗、避免污染、并擦干)

d、匀浆;(电源键控制机头启停,装有标本的1.5mlEP管置入小烧杯冰浴中,匀浆过程反复上下活动,充分匀浆组织)

4. 冰浴静置30分钟;(再加裂解液600ul至总量1000ul;)

5. 预开机制冷,12000rpm,4℃,离心20分钟;离心结束后,取上清至新1.5mlEP管;

附:低温高速离心机操作:a、开机;

b、设置speed、time、temp,注意ROTOR内外对应;12154(1.5ml或2mlEP管)

c、温度降至预设温度后,配平,开始; 6. BCA试剂盒蛋白定量

a.配制工作液;BCA试剂:CU试剂=50:1

(5mlBCA+100ulCU);(标准品数量+样品数量)×200ul;充分混匀,24小时室温稳定; b.各孔加BCA工作液200ul; c、稀释标准品;(0.5mlEP管)

①90ulPBS稀释液+10ulBSA标准品(-20℃),至100ul,浓度0.5mg/ml;

②加稀释后的标准品至96微孔板标准孔中: 20、16、12、 8、 6、 4、 2、 0 ul 加PBS补足至20ul:

0、 4、 8、12、14、16、18、20 ul 实际浓度:

0.5、0.4、0.3、0.2、0.15、0.1、0.05、0mg/ml d、样品稀释;(0.5mlEP管)(尽可能让样品点落在标准线1/2后),样品量不能少于2ul,否则误差太大。

78ul裂解液+2ul样品=40倍稀释 38ul裂解液+2ul样品=20倍稀释 加20ul样品到96孔板的样品孔中。

e、37℃孵育30分钟;(包薄膜防止水分蒸发影响检测结果) f、酶标仪A562nm测定,绘制标准曲线,计算蛋白浓度;

附:酶标仪操作:a、打开电脑主机及酶标仪主机; b、打开softmaxpro软件;

c、open drawer置入96孔板,close;

d、settings:A562nm、96孔、area,Ok; e、read;将数据直接复制至excel中;

excel中操作:a、新建excel工作表,粘贴数据;

b、标准品后插入列,输入标准品品对应浓度值,同时选中吸光度值及浓度值,插入----散点图,在任意一散点上点右键,添加趋势线,(选中公式、卡方值),卡方值常在99%以上。

c、待测样品吸光度值后插入列,将上面得到的公式插入,得到样品浓度值,均×40得实际浓度值;上样浓度预调整至2ug/ul,按每凝胶上样孔40ug/20ul×10计算,总上样量200ul,4×buffer=200ul/4=50ul,样品:4×buffer=3:1,加样量+裂解液=150ul;加样量=400u/样品浓度,裂解液=150ul-加样量;从而得出调整后加样量及裂解液量;

7、 调整加样量;按BCA蛋白测定后调整的 加样量+裂解液量+4×buffer 50ul 加入EP管;

8、 100℃水浴加热、煮沸变性5-10min(Thermo shaker);注:煮沸变性过程中会有样品溢出现象,EP

需先分装;离心(普通离心机,说明书上

管中样品若超过1ml,

10000-14000rpm离心

2-5分钟),取上清,50ul/管分装,-80℃保存或直接上样;

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