保证合同纠纷的诉讼时效中断的发生时间是：
1、债权人就主债务向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁时发生中断；
2、债权人向主债务人提出要求其履行债务的请求时发生中断；
3、主债务人同意履行义务时发生中断。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的,依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
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