工程完工结算，应当按照双方在工程合同中的约定进行。如果没有约定，就参照财政部发布的《建设工程价款结算暂行办法》进行。该结算暂行办法主要针对的内容是：
1、黑白合同造成工程价款结算争议。
2、工程竣工结算久拖不结、多头审查或一审再审。
3、工程款拖欠严重，据调查，已竣工未结算占全部竣工工程拖欠工程款的30％左右。
工程完工后，双方应按照约定的合同价款及合同价款调整内容以及索赔事项，进行工程竣工结算。
工程竣工结算方式有：工程竣工结算分为单位工程竣工结算、单项工程竣工结算和建设项目竣工总结算。
发包人收到承包人递交的竣工结算报告及完整的结算资料后，应按本办法规定的期限，进行核实（合同有约定的，从其约定），给予确认或者提出修改意见。发包人根据确认的竣工结算报告向承包人支付工程竣工结算价款，保留3％左右的质量保证（保修）金，待工程交付使用一年质保期到期后清算（合同另有约定的，从其约定），质保期内如有返修，发生费用应在质量保证金内扣除。
一、工程完工结算编制依据
1、国家有关法律、法规、规章制度和相关的司法解释；
2、国务院建设行政主管部门以及各省、自治区、直辖市和有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法、有关规定及相关解释；
3、施工方承包合同、专业分包合同及补充合同，有关材料、设备采购合同；
4、招投标文件，包括招标答疑文件、投标承诺、中标报价书及其组成内容；
5、工程竣工图或施工图、施工图会审记录，经批准的施工组织设计，以及设计变更、工程洽商和相关会议纪要；
6、经批准的开、竣工报告或停、复工报告；
7、建设工程工程量清单计价规范或工程预算定额、费用定额及价格信息、调价规定等；
8、工程预算书；
9、影响工程造价的相关资料；
10、安装工程定额基价；
11、结算编制委托合同。
法律依据：
财政部、建设部关于印发《建设工程价款结算暂行办法》的通知第十四条
工程完工后，双方应按照约定的合同价款及合同价款调整内容以及索赔事项，进行工程竣工结算。
（一）工程竣工结算方式
工程竣工结算分为单位工程竣工结算、单项工程竣工结算和建设项目竣工总结算（四）工程竣工价款结算。
发包人收到承包人递交的竣工结算报告及完整的结算资料后，应按本办法规定的期限（合同约定有期限的，从其约定）进行核实，给予确认或者提出修改意见。发包人根据确认的竣工结算报告向承包人支付工程竣工结算价款，保留5％左右的质量保证（保修）金，待工程交付使用一年质保期到期后清算（合同另有约定的，从其约定），质保期内如有返修，发生费用应在质量保证（保修）金内扣除。
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