清华大学有着光荣的革命传统，在如火如荼的抗日救亡运动中，在震撼全国的一二·九运动中，在反饥饿、反内战、反迫害斗争中，一代代清华仁人志士在探求救国道路、传播先进思想、争取民族独立和人民解放斗争中成为后世的楷模。1949年后，校长梅贻琦等人随国民政府迁往中国台湾。清华归属中央人民政府教育部，更名“清华大学”1955年，梅贻琦在新竹主持国立清华大学“在台复校”，沿用原校名。二十世纪80年代以来，两校交往日渐频繁，“一笔写不出两个清华”。20__年，两岸清华大学还将共同举办“百年校庆”的相关活动。
1952年中国高等教育体系仿照苏联社会主义模式进行大规模的院系调整，清华的1934年6月，清华的院系研究所、文学院、理学院、法学院、农学院、航空等院系被迫割离母校而划归北京大学等校，同时吸收国内其他高校的工科院系，使清华大学成为一所多科性的工科大学，重点为国家培养工程技术人才，这一做法现为多数校友及学术界、教育界强烈否定。1952年11月蒋南翔出任清华大学校长，积极探索符合中国国情的社会主义高等教育的办学道路，在培养又红又专、全面发展的工程技术和尖端科技人才方面成绩卓著。
从1953年起率先实行“政治辅导员”制度，让优秀学生党员“双肩挑”(专业学习和政治工作)，延续至今。当时的清华被称为“红色工程师的摇篮”。同年，清华着手进行“学习苏联先进教育经验”的教学改革，按计划培养技术人才，从学分制转为学年制，学制延长，建立教学大纲，翻译大量苏联教材，加强基础课，聘请苏联专家讲学。1955年后，增设实验核物理、放射性稀有元素工艺学等新技术专业。1958年后，开展教育领域“大跃进”。实行教育与生产劳动相结合、勤工俭学、教育支援农业，清华师生承担了密云水库、中国革命历史博物馆等实践工作。 1978年以来，在深化改革、扩大开放的过程中，清华逐步复建了理科、经济、管理、人文、社会科学等各学科，恢复了综合性大学的布局，进入了一个蓬勃发展的新时期。
高校院系调整前后，清华大学院系的变化目前，清华大学设有建筑学院、土木水利学院、机械工程学院、航天航空学院、信息科学技术学院、理学院、生命科学学院、医学院、地球科学学院(筹)、人文社会科学学院、新闻与传播学院、法学院、马克思主义学院、经济管理学院、公共管理学院、美术学院、应用技术学院等，以及清华大学生物科学与技术系(20__年9月28日成立清华大学生命科学学院，同时撤销该建制)、生物信息与系统生物学、医学系统生物学研究中心等院系。清华大学已成为一所具有理、工、文、法、医学、经济、管理、艺术等学科的综合性大学。水清木华，钟灵毓秀，清华园散发着独特的精神魅力。
清芬挺秀，华夏增辉，今天的清华大学面临着前所未有的历史机遇，新时代的清华人继承“爱国奉献、追求卓越”的优良传统，秉承“自强不息、厚德载物”的校训和“行胜于言”的校风，努力跻身世界一流大学行列，为中华民族的伟大复兴而努力奋斗。
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