商贷没还完可以进行公积金贷款。职工只要符合正常汇缴公积金6个月以上等公积金贷款申请条件,即可申请办理公积金贷款,与职工是否有未还清的商业贷款无关。但同时公积金中心也提醒,公积金贷款月还款额应不高于家庭月收入的50%,如有未还清的商业性住房贷款,应自行安排好还贷资金。另外,注意如果首套房使用的是商贷,想使用公积金贷款购买二套房,可贷额度是:核算能贷额度减去首套房的贷款额度,如果首套房贷款额度过高的话,也可能无法办理公积金贷款。法律依据《住房公积金管理条例》第二十六条 缴存住房公积金的职工,在购买、建造、翻建、大修自住住房时,可以向住房公积金管理中心申请住房公积金贷款。住房公积金管理中心应当自受理申请之日起15日内作出准予贷款或者不准贷款的决定,并通知申请人;准予贷款的,由受委托银行办理贷款手续。住房公积金贷款的风险,由住房公积金管理中心承担。《住房公积金管理条例》第二十七条 申请人申请住房公积金贷款的,应当提供担保。《住房公积金管理条例》第二十八条 住房公积金管理中心在保证住房公积金提取和贷款的前提下,经住房公积金管理委员会批准,可以将住房公积金用于购买国债。住房公积金管理中心不得向他人提供担保。